Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SptssbQ925E8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SptssbQ925E8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms