Protein–RNA interactions for Protein: Q91WW7

Pnpla3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla3Q91WW7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pnpla3Q91WW7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla3Q91WW7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms