Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC12Q8WUD4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC12Q8WUD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms