Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3aQ8VHT7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3aQ8VHT7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms