Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne5Q8JZW4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne5Q8JZW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms