Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arhgap29Q8CGF1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap29Q8CGF1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms