Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms