Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54bQ6PFE3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54bQ6PFE3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms