Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms