Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltbQ6IRU5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms