Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp248Q640N4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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