Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Lcn3Q62471 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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