Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp49aQ61450 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms