Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms