Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc106Q3ULM0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms