Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOXD1Q16676 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
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