Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A6Q14031 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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