Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DQ08499 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms