Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dpf3P58269 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dpf3P58269 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms