Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Polr1cP52432 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1cP52432 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms