Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SMARCA2P51531 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms