Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sox7P40646 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox7P40646 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms