Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc3P33622 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms