Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC27P30260 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC27P30260 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC27P30260 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC27P30260 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms