Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxb1P17919 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hoxb1P17919 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hoxb1P17919 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hoxb1P17919 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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