Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd1d1P11609 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms