Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD2P0DJD1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms