Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bnc1O35914 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bnc1O35914 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms