Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl25O35903 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms