Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm5849J3QPE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm5849J3QPE5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm5849J3QPE5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm5849J3QPE5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm5849J3QPE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5849J3QPE5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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