Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc180J3QNE4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ccdc180J3QNE4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ccdc180J3QNE4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ccdc180J3QNE4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ccdc180J3QNE4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc180J3QNE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms