Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms