Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3173A6NAS3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms