Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrp1bA1Z198 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms