Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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