Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms