Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ilf3Q9Z1X4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ilf3Q9Z1X4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms