Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnmdQ9Z1F6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CnmdQ9Z1F6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms