Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F5

Ch25h, Cholesterol 25-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ch25hQ9Z0F5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ch25hQ9Z0F5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ch25hQ9Z0F5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms