Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX20Q9UHI6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms