Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Six6Q9QZ28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Six6Q9QZ28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms