Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja4Q9JMC3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms