Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KnstrnQ9D9Z1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms