Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jam3Q9D8B7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms