Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Obox1Q9D350 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Obox1Q9D350 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Obox1Q9D350 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Obox1Q9D350 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms