Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms