Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nudt21Q9CQF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms