Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUSD3Q96L08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUSD3Q96L08 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms