Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP13Q92995 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP13Q92995 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP13Q92995 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP13Q92995 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP13Q92995 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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