Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx8Q8CFD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx8Q8CFD4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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